کلینیک زنان مهرآیین یکی از قدیمی ترین کلینیکهای این بیمارستان می باشد که با بهره گیری از حضور متخصصین معتمد و کار آزموده ، درمان طبی و جراحی بیماران زنان ، زایمان ، نازایی و مامایی را انجام میدهند . مراقبت حین بارداری ، انجام تستهای دوره ای ، غربالگری ، پاپ اسمیر و NST ىر اين كلينيك صورت ميگيرد . از وي‍ژگي بارز مهرآيين وجود متخصصين آنكال زنان براي ارائه خدمت به بيماران اور‍‍‍ژانسی و بستری شده مي باشد